Евгений родился в 1966 году в Ульяновске. В 1990 году получил диплом с отличием в Санкт-Петербургском университете экономики и финансов по специальности «Экономическая кибернетика». Закончил аспирантуру в Санкт-Петербургском университете экономики и финансов и Executive-MBA в Высшей школе экономики. Стажировался в ESC-Lyon (Ecole Superior de Commerce), SDA Bocconi University, Henley Management College.
Начиная с 1990 года Евгений Плаксенков был соучредителем ряда компаний, разработал более 20 программ акционирования российских компаний, работал директором корпоративных программ Санкт-Петербургского международного института менеджмента (IMISP), директором по человеческим ресурсам компании ОТИС-Россия/Восточная Европа (OTIS), финансовым и генеральным директором инвестиционно-девелоперского холдинга МИЭЛЬ, независимым директором в составе Советов директоров и Наблюдательных советов российских и международных компаний.